حداقل طول دوره دکتری داروسازی 5/5 سال می باشد و بیشینه آن 9 سال می‌باشد لازم به توضیح است که سنوات تحصیلی دانشجویان مشمول نظام وظیفه حداکثر 8 سال می باشد و کمیسیون موارد خاص دانشگاه میتواند 2 ترم به آن اضافه نماید. تعداد کل واحدهای درسی دوره211واحد (در 2 مرحله) می‌باشد، که شامل موارد زیر می‌شود:
مرحله اول: دروس عمومی، دروس پایه، اکثر دروس اختصاصی نظری و عملی و کارآموزی و پایان نامه 1، که در مجموع معادل با 180 واحد می باشد. دانشجو ملزم به شرکت و قبولی در آزمون جامع داروسازی پس از گذراندن 180 واحد می باشد و پس از آن مجاز به شروع مرحله دوم از دروس خود خواهد بود.
مرحله دوم: دو درس عمومی، دروس اختصاصی باقیمانده، کارآموزی داروخانه شهری (2)، کارآموزی مقدماتی صنعت و پایان نامه 2 و 3، که در مجموع معادل با 31 واحد می باشد.
واحدهای عمومی : 24 واحد
واحدهای پایه : 58 واحد
واحدهای اختصاصی و پایان نامه : 129 واحد
هر واحد کارآموزی معادل با 51 ساعت می باشد.
کارآموزی داروخانه شهری (1) 2 واحد معادل102ساعت
کارآموزی داروخانه بیمارستانی 2 واحد معادل102ساعت
کارآموزی داروخانه شهری (2) 2 واحد معادل 102 ساعت
کارآموزی در عرصه داروخانه شهری 6 واحد معادل 306 ساعت
کار آموزی مقدماتی صنعت 2 واحد معادل102ساعت
پایان نامه‌ها
پایان نامه 1 2 واحد
پایان نامه 2 2 واحد
پایان نامه 3 4 واحد
دانشجویان پس از گذراندن 140 واحد درسی می بایستی تا یکسال موضوع پایان نامه خود را انتخاب و ثبت کنند.
جهت ثبت موضوع پایان نامه باید مراحل ذیل طی شود:
الف- انتخاب موضوع پایان نامه با هدایت استاد راهنما
ب- بررسی تکراری نبودن موضوع پایان نامه توسط معاونت پژوهشی دانشکده
ج- تصویب طرح توسط گروه آموزشی مربوطه
د- ارائه طرح در معاونت پژوهشی دانشکده جهت تصویب آن
ه- ابلاغ مصوبه شورای پژوهشی دانشکده به استاد راهنما جهت شروع پایان نامه
تبصره: فاصله زمان ثبت موضوع پایان نامه تا زمان دفاع نباید کمتر از یکسال باشد. کلیه دانشجویان موظف به دفاع از پایان نامه در آخرین نیمسال تحصیلی می باشند و چنانچه دانشجو در چهارچوب سنوات مجاز تحصیلی نتواند از پایان نامه خوددفاع و نمره قبولی کسب کند، علیرغم اینکه کلیه واحدهای درسی دوره آموزشی مربوطه را با موفقیت گذرانده باشد، اخراج خواهد شد.
